После того, как заделали стены штукатуркой, покрасили их, а некоторые дырочки так и остались заметны. Чем можно их прикрыть?

Да, к сожалению, без этого никак. Есть дырочки на стенках, как не крути, редко, кому удается легко и просто все сразу сделать. В любом случае, я рекомендую присмотреть тут специальные кронштейны для таких целей https://salon-oboev.ru/katalog/lepnina/kronshteyn_evroplast_1_19_015/. Именно такой вариант мы недавно взяли в спальню, где у нас на стенах приличные дефекты были. Так и дырку закрыли, и вид придали совершенно другой.