Тебе нужно сначала все файлы объединить в одном месте и проверить, что они корректно открываются. Я год назад готовил документы для клиники в Израиле, тоже была куча разных исследований. Использовал специальный браузерный инструмент для работы с медицинскими форматами - загрузил туда все файлы с дисков и убедился, что все читается нормально. Зашел на dicom-viewer.online/en/ и по очереди проверил каждое исследование. Потом эти файлы можно упаковать в архив и отправить через защищенный файлообменник, который укажет клиника.
Online DICOM Viewer помог понять, что у меня одна серия снимков была повреждена - пришлось в больнице новую копию запрашивать. Обязательно сделай резервные копии всего на облачный диск, мало ли что с носителями случится.